#参考https://www.jieandze1314.com/post/cnposts/141/
#参考https://www.jieandze1314.com/post/cnposts/245/
# 原本有4个R包路径，现在再添加一个
myPaths <- .libPaths()  
new <- c('~/r-2nd-pkgs')
myPaths <- c(myPaths, new) 
.libPaths(myPaths) 
.libPaths()

# 接下来调整位置，第一个是默认安装路径（位置随意调整）
myPaths <- .libPaths()  
myPaths <- c(myPaths[5], myPaths[2],myPaths[1],myPaths[3],myPaths[4])  
.libPaths(myPaths) 
.libPaths()

# 接下来就能在新的路径下安装其他版本了，例如安装seurat 2.3.4，它还需要其他依赖包
pkgs = c( 'mixtools', 'lars', 'dtw', 'doSNOW', 'hdf5r','fpc','foreach' ) 
BiocManager::install(pkgs,ask = F,update = F)
packageurl <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Seurat/Seurat_2.3.4.tar.gz"
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")

# 最后卸载之前的版本，加载新建版本
detach("package:Seurat", unload=TRUE)
library(Seurat, lib.loc="~/r-2nd-pkgs") 
packageVersion('Seurat')


# 配置一个R 4.0
conda create -n R4 -y
source activate R4
conda install r-base -y
# 然后用conda继续安装seurat
 conda install -c bioconda r-seurat -y

将conda的安装路径设置成Server默认安装的路径。
myPaths <- .libPaths()  
new <- c('/home/miniconda3/envs/R4/lib/Rlibrary/')
myPaths <- c(myPaths, new) 
.libPaths(myPaths) 
.libPaths()
这样在console中修改，只能持续一次，等你下次重新打开Rstudio时就失效了。为了以后的方便，可以在.Rprofile中配置好
file.edit('~/.Rprofile')
# 然后添加下面的内容
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

R_LIBS="/home/miniconda3/envs/R4/lib/R/library/"
之后，每次重启就会默认切换到这个路径进行安装了