################生成特征表和代表序列######## cd /home/data/ssy051/container/qiime2-2019.7_ceshi-yes nohup docker run --rm -v /home/data/ssy051/container/qiime2-2019.7_ceshi-yes:/home \ …

seq_dir=/home/data/ssy051/container/pgap/input # PGAP-formatted input filesout_dir=/home/data/ssy051/container/pgap/output # Output directory (should exist)strains=AHWH11M1+AH…

wsl --import Ubuntu-20.04 d:\Wsl\Ubuntu-20.04 D:\Wsl\Ubuntu-20.04.tar wsl -l wsl --export Ubuntu-20.04 D:\Wsl\Ubuntu-20.04.tar wsl --unregister Ubuntu-20.04 wsl --import Ubunt…

library(multcompView) library(stats) library(tidyverse) library(ggsci) data2 <- ToothGrowth data2$dose = as.factor(data2$dose) anova <- aov(len ~ supp*dose, data = data2…

#!/usr/bin/env Rscript ################################# # # Functions # ################################# process_pairs <- function(idx, td) { mindbc <- dbcan[dbcan…

来源于：https://www.jianshu.com/p/67be9b3806cd 1. 何时使用非参数检验 或许你还没有理解什么是参数检验、非参数检验，但一定曾在无意之中使用过它们。如我们常用的方差分析、T检验，都属于参数检验。 参数检验，就是假定数据服从某种分布，通过样本信息对总体参数进行检验。因而在分析前，先要检验数据是否符合该类型的分布，…

# # install.packages("devtools") # library(devtools) # install_github('yikeshu0611/rs.driver') # 安装R包 #install.packages('RSelenium') #java -Dwebdriver.chrome.driver="chromedri…

######################################安装包######################### #~/MetaboAnalyst，MetaboAnalyst/cq # # install.packages('devtools') # # options(BioC_mirror="https://mirrors.…

library(psych) genedat <- read.table('index.txt', header = TRUE, sep = '\t') antidat <- read.table('meta.txt',header = TRUE, sep = '\t') res <- corr.test(genedat, ant…

# 首先要安装devtools包，仅需安装一次 install.packages("devtools") # 加载devtools包 library(devtools) # 下载ggvegan包 devtools::install_github("gavinsimpson/ggvegan") library(ggvegan) otu.tab <…