# Huang WC, Liu Y, Zhang X, Zhang CJ, Zou D, Zheng S, Xu W, Luo Z, Liu F, Li M. #Comparative genomic analysis reveals metabolic flexibility of Woesearchaeota. #Nat Commun. 202…

#来源于https://mp.weixin.qq.com/s/j901X2DYQhyFXGRNEFaoaQ #eggnog-mapper软件来对基因做功能注释，由于需要注释的基因有10万条，在线版单次只支持5000 #条序列因此使用本地版来进行注释 conda create -n eggnog-mapper -c bioconda eggnog-m…

.tar 解包：tar xvf FileName.tar 打包：tar cvf FileName.tar DirName （注：tar是打包，不是压缩！） ——————————————— .gz 解压1：gunzip FileName.gz 解压2：gzip -d FileName.gz 压缩：gzip FileName .tar.gz 和 .tg…

1,520 reference genomes from cultivated human gut bacteria enable functional microbiome analyses Nature Biotechnology [IF:54.908] DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-018-0…

nohup wget -c ftp://download.nmdc.cn//tools/metawrap/NCBI_nt \ -r \ --ftp-user "anonymous" & ascp -QT -l 300m -P 33001 -i path/to/aspera/installation/etc/asperaweb_id_dsa.…

Aspera是一项突破性传输协议，充分利用现有的 WAN 基础设施和通用硬件，传输速度比 FTP 和 HTTP 快达数百倍。 mkdir ~/Biosofts cd ~/Biosofts wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.6.2/aspera-connect-3.6…

#会了它就可以知道哪个基因属于哪个通路，以及不同通路中包含的基因 #参考https://www.jieandze1314.com/post/cnposts/185/ # if (!require("BiocManager", quietly = TRUE)) # install.packages("BiocManager") # BiocManag…

#参考https://www.jieandze1314.com/post/cnposts/141/ #参考https://www.jieandze1314.com/post/cnposts/245/ # 原本有4个R包路径，现在再添加一个 myPaths <- .libPaths() new <- c('~/r-2nd-pkgs') m…

### #Pedersen, H.K., Forslund, S.K., Gudmundsdottir, V. et al. A computational #framework to integrate high-throughput ‘-omics’ datasets for the identification #of potential m…

> library(multcompView) > library(stats) > library(tidyverse) > library(ggsci) > > data2 <- ToothGrowth > data2$dose = as.factor(data2$dose) > > anova <- aov(len ~ supp*…